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DNA合成仪的使用方法操作步骤

        以亚磷酰胺寡核苷酸合成为例介绍该类仪器的一般操作步骤。亚磷酰胺DNA合成的试剂有:保护碱基的5/—DMT,A、G、C、T亚磷酰胺单体,四唑偶联催化剂,乙酐,N—甲基咪唑封闭试剂,三氯乙酸(TCA)脱保护溶液,12氧化混合物,乙腈清洗溶剂,氨水切除溶液。使用步骤如下:
        1)仔细检查合成仪上所有试剂瓶中的试剂量,必要时换掉试剂瓶,特别注意乙腈的量,因为该溶剂用量较大。
        2)将标记好的清洁的收集瓶装在合成仪上。
        3)将要合成的DNA序列输入合成仪。
        4)检查选择的合成步骤是否正确。
        5)选择结束方法:TritylOffAuto是仪器的原始状态,若打算以5,—DMT基团连接纯化寡核苷酸,将其转变为TritylOnAuto结束状态。
        6)如果分部收集器用来收集每个DMT脱保护步骤的流出物,确保试管充分清洁干净,并打开分部收集器,确保DMT废液管路通向分部收集器。
        7)启动循环,运行开始程序清洗试剂管路,除去原来的试剂。

        注意:TritylOnAuto表示在合成寡核苷酸的5’端核苷酸带有一个DMT,并将其从固相载体上切下来,储存在收集瓶中;TritylOffAuto表示在合成寡核苷酸的5,端核苷酸没有保护基团,将其从固相载体上切下来,储存在收集瓶中;TritylOnManual表示合成寡核苷酸的5’端核苷酸带有一个DMT,寡核苷酸没有从固相载体上切下来,而是保留在合成柱中;TritylOffManual表示在合成寡核苷酸的5,端核苷酸没有保护基团,寡核苷酸没有从固相载体上切下来,而是保留在合成柱中。

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