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多肽合成仪的问世大大促进了多肽科学的发展。反过来，随着多肽科学的发展，科学家也对合成仪提出了更高的要求，从而带动了合成仪的发展。目前多肽合成仪品种繁多，从合成量上分，可分为微克级的，毫克级的，克级的和公斤级的；从功能上分，可分为研究型的，小试型的，中试型的，普通生产型的和GMP生产型的；从自动化程度上分，可分为全自动的，半自动的和手动的；从通道上分，可分为单通道的和多通道的；从技术角度上分，可分为**代的，**代的，和第三代的；等等
参考科研单位选购小型设备的考虑因素，对于生产型企业，使用不同品牌的多肽合成仪往往还应考虑其连贯完整的设备生产线，从小型合成规模至生产型合成规模的各种设备齐全。通常大型设备可根据反应器大小判断其合成规模，通常可在线切割的玻璃材质反应器/反应釜需达100L，可保证批量产数十公斤的多肽产品。